MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 1917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	CTTC	2	8	258	265	0 %	50 %	0 %	50 %	319760025
2	NC_014908	CGC	2	6	267	272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
3	NC_014908	TGC	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760025
4	NC_014908	ACG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
5	NC_014908	TTC	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760025
6	NC_014908	CG	3	6	432	437	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
7	NC_014908	CGA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
8	NC_014908	GGC	2	6	487	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760025
9	NC_014908	GCG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760025
10	NC_014908	TGCG	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	319760025
11	NC_014908	AGT	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760025
12	NC_014908	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
13	NC_014908	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760025
14	NC_014908	GCT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760025
15	NC_014908	GC	5	10	766	775	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
16	NC_014908	GCC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
17	NC_014908	ACC	2	6	881	886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760025
18	NC_014908	GC	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
19	NC_014908	ACG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
20	NC_014908	AGG	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760025
21	NC_014908	CTT	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760026
22	NC_014908	TCG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760026
23	NC_014908	GTG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760026
24	NC_014908	AGC	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760026
25	NC_014908	GC	3	6	1557	1562	0 %	0 %	50 %	50 %	319760026
26	NC_014908	TCG	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760026
27	NC_014908	GAT	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760026
28	NC_014908	AGA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760026
29	NC_014908	CCA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760026
30	NC_014908	AG	3	6	1768	1773	50 %	0 %	50 %	0 %	319760026
31	NC_014908	CGAG	2	8	1803	1810	25 %	0 %	50 %	25 %	319760026
32	NC_014908	CCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760026
33	NC_014908	GCCC	2	8	1910	1917	0 %	0 %	25 %	75 %	319760026
34	NC_014908	GAAT	2	8	3066	3073	50 %	25 %	25 %	0 %	319760027
35	NC_014908	AC	3	6	3359	3364	50 %	0 %	0 %	50 %	319760028
36	NC_014908	CGA	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760028
37	NC_014908	CG	3	6	3487	3492	0 %	0 %	50 %	50 %	319760028
38	NC_014908	CGCT	2	8	3499	3506	0 %	25 %	25 %	50 %	319760028
39	NC_014908	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760028
40	NC_014908	CGCT	2	8	3560	3567	0 %	25 %	25 %	50 %	319760028
41	NC_014908	TCAGT	2	10	3653	3662	20 %	40 %	20 %	20 %	319760028
42	NC_014908	GCC	2	6	3690	3695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760028
43	NC_014908	GA	3	6	3768	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	319760028
44	NC_014908	GCA	2	6	3780	3785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760028
45	NC_014908	AAGC	2	8	3787	3794	50 %	0 %	25 %	25 %	319760028
46	NC_014908	GAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760029
47	NC_014908	GC	3	6	4366	4371	0 %	0 %	50 %	50 %	319760029
48	NC_014908	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760029
49	NC_014908	TGG	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760029
50	NC_014908	TTC	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760029
51	NC_014908	CG	3	6	4561	4566	0 %	0 %	50 %	50 %	319760029
52	NC_014908	GCG	2	6	4668	4673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760030
53	NC_014908	GAA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760030
54	NC_014908	GAG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760030
55	NC_014908	G	6	6	4800	4805	0 %	0 %	100 %	0 %	319760030
56	NC_014908	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760030
57	NC_014908	AGA	2	6	5036	5041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760031
58	NC_014908	ACA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760031
59	NC_014908	CCT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760031
60	NC_014908	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760031
61	NC_014908	GTG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760031
62	NC_014908	TCG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760031
63	NC_014908	GTC	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760031
64	NC_014908	ATT	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760032
65	NC_014908	GGC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
66	NC_014908	CTGGG	2	10	5501	5510	0 %	20 %	60 %	20 %	319760032
67	NC_014908	GGT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760032
68	NC_014908	GCG	3	9	5540	5548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
69	NC_014908	AAG	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760032
70	NC_014908	AG	3	6	5709	5714	50 %	0 %	50 %	0 %	319760032
71	NC_014908	GGAC	2	8	5757	5764	25 %	0 %	50 %	25 %	319760032
72	NC_014908	TGGG	2	8	5793	5800	0 %	25 %	75 %	0 %	319760032
73	NC_014908	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760032
74	NC_014908	GGGCAA	2	12	6067	6078	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319760032
75	NC_014908	AGC	2	6	6175	6180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
76	NC_014908	GTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760032
77	NC_014908	GGGC	2	8	6310	6317	0 %	0 %	75 %	25 %	319760032
78	NC_014908	GC	4	8	6343	6350	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
79	NC_014908	AAGTC	2	10	6378	6387	40 %	20 %	20 %	20 %	319760032
80	NC_014908	TCA	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
81	NC_014908	ACG	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
82	NC_014908	CTA	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
83	NC_014908	CACG	2	8	6517	6524	25 %	0 %	25 %	50 %	319760032
84	NC_014908	GAT	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760032
85	NC_014908	TGT	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760032
86	NC_014908	CGT	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760032
87	NC_014908	GC	3	6	6659	6664	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
88	NC_014908	ATC	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
89	NC_014908	CGA	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
90	NC_014908	CGG	2	6	6762	6767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
91	NC_014908	GCC	2	6	6833	6838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760032
92	NC_014908	GGT	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760032
93	NC_014908	CAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760032
94	NC_014908	GC	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
95	NC_014908	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
96	NC_014908	CCAACA	2	12	6975	6986	50 %	0 %	0 %	50 %	319760032
97	NC_014908	GAA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760032
98	NC_014908	ACC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760032
99	NC_014908	TGAG	2	8	7179	7186	25 %	25 %	50 %	0 %	319760032
100	NC_014908	T	7	7	7201	7207	0 %	100 %	0 %	0 %	319760032
101	NC_014908	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
102	NC_014908	ACCA	2	8	7478	7485	50 %	0 %	0 %	50 %	319760033
103	NC_014908	CCA	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760033
104	NC_014908	GCTG	2	8	7542	7549	0 %	25 %	50 %	25 %	319760033
105	NC_014908	TCG	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760033
106	NC_014908	TGC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760033
107	NC_014908	TGG	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760033
108	NC_014908	TTC	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760033
109	NC_014908	AGC	3	9	7834	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760033
110	NC_014908	GCT	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760034
111	NC_014908	GCC	3	9	8062	8070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760034
112	NC_014908	CTGG	2	8	8142	8149	0 %	25 %	50 %	25 %	319760034
113	NC_014908	TTG	2	6	8192	8197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760034
114	NC_014908	CATC	2	8	8316	8323	25 %	25 %	0 %	50 %	319760034
115	NC_014908	ATG	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760034
116	NC_014908	ATT	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760034
117	NC_014908	AAG	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760034
118	NC_014908	CT	3	6	8520	8525	0 %	50 %	0 %	50 %	319760034
119	NC_014908	AGC	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760034
120	NC_014908	CTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760034
121	NC_014908	AAT	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760035
122	NC_014908	TTC	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760035
123	NC_014908	CTC	2	6	8757	8762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760035
124	NC_014908	GGC	2	6	8769	8774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760035
125	NC_014908	ATC	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760035
126	NC_014908	AGC	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
127	NC_014908	ATT	2	6	8877	8882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760035
128	NC_014908	CGC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760035
129	NC_014908	TAA	2	6	8954	8959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760035
130	NC_014908	CAG	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
131	NC_014908	CGT	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760035
132	NC_014908	AGA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760035
133	NC_014908	CAG	2	6	9041	9046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
134	NC_014908	AGA	2	6	9047	9052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760035
135	NC_014908	ATG	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760036
136	NC_014908	CGC	2	6	9359	9364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760036
137	NC_014908	GGCG	2	8	9444	9451	0 %	0 %	75 %	25 %	319760036
138	NC_014908	CAA	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760036
139	NC_014908	CAG	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760036
140	NC_014908	ACA	2	6	9541	9546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760036
141	NC_014908	A	7	7	9692	9698	100 %	0 %	0 %	0 %	319760036
142	NC_014908	GCG	2	6	9702	9707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760036
143	NC_014908	AAG	2	6	9729	9734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760036
144	NC_014908	AATG	2	8	9797	9804	50 %	25 %	25 %	0 %	319760036
145	NC_014908	CGA	2	6	11462	11467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760037
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149	NC_014908	CAT	2	6	11618	11623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760037
150	NC_014908	CT	3	6	11630	11635	0 %	50 %	0 %	50 %	319760037
151	NC_014908	CG	3	6	11656	11661	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
152	NC_014908	TGA	2	6	11725	11730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760037
153	NC_014908	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
154	NC_014908	CCG	2	6	11830	11835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760037
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166	NC_014908	CAA	2	6	12950	12955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760037
167	NC_014908	AAAC	2	8	13057	13064	75 %	0 %	0 %	25 %	319760037
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169	NC_014908	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	319760037
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188	NC_014908	TGG	2	6	15133	15138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760040
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259	NC_014908	CGA	2	6	18849	18854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
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261	NC_014908	ACG	2	6	18875	18880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
262	NC_014908	AG	3	6	18882	18887	50 %	0 %	50 %	0 %	319760045
263	NC_014908	GAT	2	6	18904	18909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760045
264	NC_014908	GAC	2	6	18955	18960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
265	NC_014908	CG	3	6	19150	19155	0 %	0 %	50 %	50 %	319760045
266	NC_014908	CATG	2	8	19161	19168	25 %	25 %	25 %	25 %	319760045
267	NC_014908	CCA	2	6	19193	19198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760045
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269	NC_014908	ACA	2	6	19283	19288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760045
270	NC_014908	GTTT	2	8	19334	19341	0 %	75 %	25 %	0 %	319760045
271	NC_014908	CTC	2	6	19438	19443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760045
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273	NC_014908	ACG	2	6	19505	19510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
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275	NC_014908	ATC	2	6	19866	19871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760045
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277	NC_014908	CTC	2	6	19935	19940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760045
278	NC_014908	GTC	2	6	20111	20116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760045
279	NC_014908	TGA	2	6	20126	20131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760045
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281	NC_014908	GGGC	2	8	20189	20196	0 %	0 %	75 %	25 %	319760045
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283	NC_014908	TCAT	2	8	20308	20315	25 %	50 %	0 %	25 %	319760045
284	NC_014908	CGA	2	6	20373	20378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
285	NC_014908	CGA	2	6	20436	20441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
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289	NC_014908	GCA	2	6	20694	20699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760045
290	NC_014908	GGT	2	6	20700	20705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760045
291	NC_014908	TCA	2	6	20717	20722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760045
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293	NC_014908	TCT	2	6	20796	20801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760045
294	NC_014908	CGG	2	6	20859	20864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760045
295	NC_014908	CGC	2	6	20928	20933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760045
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303	NC_014908	GTG	2	6	21407	21412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760046
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389	NC_014908	TGA	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760050
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392	NC_014908	GT	3	6	26813	26818	0 %	50 %	50 %	0 %	319760050
393	NC_014908	ACG	2	6	26929	26934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760050
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